Ilmuwan Komputer Bertujuan untuk Membawa Data Kanker ke Tempat Tidur Pasien
Tech

Ilmuwan Komputer Bertujuan untuk Membawa Data Kanker ke Tempat Tidur Pasien

Ilmuwan komputer University of Texas di Arlington, Jacob Luber, telah memperoleh hibah selama lima tahun senilai $2 juta dari Cancer Prevention and Research Institute of Texas (CPRIT) untuk membuat database yang berisi setiap kumpulan data kanker yang tersedia untuk umum dari National Cancer Institute (NCI) .

Pembedahan. Kredit gambar: Max Pixel, CC0 Domain Publik

Basis data akan memungkinkan peneliti dan dokter untuk memetakan di mana pasien kanker memiliki sifat yang sama dan meningkatkan serta memperluas perawatan berdasarkan data tersebut. Kumpulan data tersebut saat ini terlalu besar untuk diakses oleh dokter dengan mudah.

Seorang asisten profesor di Departemen Ilmu Komputer dan Teknik dan dengan Pusat Multi-Interprofessional untuk Informatika Kesehatan (MICHI) UTA, Luber sedang mengembangkan algoritme yang mengompresi data bioinformatika yang terkait dengan kanker. Dengan menggunakan teknik pembelajaran mendalam, dia mengeksplorasi cara mengurangi ukuran kumpulan data yang sangat besar dari hingga tiga petabyte menjadi 12 terabyte yang lebih mudah dikelola. Satu petabyte setara dengan 1.000 terabyte data.

“Dengan pembelajaran yang mendalam, kita dapat mengambil gambar berdimensi tinggi dengan data proteomik yang dilapis di atasnya dan mengompresnya, kemudian menggunakannya untuk menemukan kesamaan antar pasien,” kata Luber, yang juga merupakan CPRIT Scholar di Cancer Research. “Setelah kesamaan itu diidentifikasi, dokter dapat menambang catatan kesehatan elektronik untuk melihat perawatan apa yang paling efektif dan menyesuaikan rejimen pengobatan yang sesuai.”

Marion Ball, direktur eksekutif MICHI, mengatakan pekerjaan Luber merupakan kontribusi berharga bagi upaya informatika kesehatan di pusat tersebut.

“MICHI melakukan penelitian di dua area fokus yang menjadi pusat tujuan strategis jangka panjang UTA: penemuan dan kesehatan berbasis data dan kondisi manusia,” kata Ball, Profesor Terhormat Presiden dan Ketua Terhormat Raj dan Indra Nooyi di Bioengineering. “Dr. Program penelitian Luber secara sempurna menjembatani kedua bidang ini dengan memanfaatkan superkomputer skala besar untuk memahami data berorientasi kesehatan dan kemudian mendorong program penelitian baru yang menangani penyakit baik melalui pendekatan algoritmik di klinik maupun penemuan obat yang dipandu pembelajaran mesin.”

Pada akhirnya, penelitian akan memungkinkan dokter untuk memasukkan data pasien dan mengakses indeks yang lebih besar melalui komputer di samping tempat tidur pasien atau di ruang pemeriksaan. Selain itu, indeks pencitraan juga akan digunakan untuk upaya penemuan obat lebih lanjut dengan lebih memahami bagaimana bahan kimia yang berasal dari mikrobioma memengaruhi cara sistem kekebalan tubuh melawan kanker.

“Dr. Pengalaman pascadoktoral Luber di NCI memberinya perspektif unik tentang bagaimana mendekati masalah membuat kumpulan data yang sangat besar dapat diakses oleh dokter dan orang lain yang tidak memiliki akses ke superkomputer,” kata Hong Jiang, ketua Departemen Ilmu dan Teknik Komputer. “Penelitiannya adalah aplikasi pembelajaran mendalam yang sangat baik yang dapat membuat perbedaan besar dalam efektivitas perawatan kanker.”

Luber, yang memiliki janji sekunder di Departemen Bioengineering di UTA dan di Laboratorium Ilmu Data Kanker NCI, menggunakan dana Akuisisi dan Retensi Sains dan Teknologi Sistem UT untuk membeli superkomputer untuk proyek ini. Hibah CPRIT akan memungkinkan dia untuk mempekerjakan beberapa mahasiswa doktoral dan peneliti postdoctoral untuk membantunya dalam membuat indeks.

Sumber: Universitas Texas di Arlington



Posted By : pengeluaran hk hari ini